تم تأسيس معهد التكنولوجيا التطبيقية في عام 2005 بقرار أميري وبرؤية من سمو الشيخ محمد بن زايد آل نهيان، ولي عهد أبو ظبي نائب القائد الأعلى للقوات المسلحة، وبرعاية حكومة أبو ظبي .
يضم معهد التكنولوجيا التطبيقية فرع الفجيرة ثلاثمائة وخمسة عشر طالبا يدعمهم سبعة وثلاثون مدرسا وثمانية عشر إداريا. ويضم حرم المدرسة المرافق التالية: أربعة وأربعون فصلا دراسيا، وخمس غرف للموظفين، وعشر ورش عمل، وأحد عشر مختبرا للحاسب الآلي، ومختبرين للعلوم، وقاعة للمحاضرات، ومركز التثقيف المجتمعي، ومطعمان، وناد ترفيهي للطلاب، ومكتبة، وملعب لكرة القدم حوله مضمار للجري، وملاعب للتنس وكرة السلة والكرة الطائرة وصالة رياضية قيد التخطيط ومواقف سيارات مظللة للموظفين.
عندما يدخل الزوار إلى حرم معهد التكنولوجيا التطبيقية فرع الفجيرة يستقبلهم حراس أمن لطفاء وموظفون ودودون في قاعة الاستقبال الرئيسية حيث يعرضون عليهم المرطبات و المشروبات الساخنة أثناء انتظارهم قبل ذهابهم إلى وجهتهم المقصودة داخل المدرسة.